Na pražském Zlíchově, na okraji návrší Dívčí hrady, se nalézá významné naleziště zkamenělin, známé již od dob Joachima Barranda, a chráněné od roku 1988.
Atlas lokalit
Český kras, Praha, Homolka – přírodní rezervace
V jihozápadní části Prahy, v katastru Velké Chuchle, se rozkládá na 13,4 ha rozsáhlý skalní výchoz a bývalý lom Homolka. Jedná se o významnou geologickou lokalitu, jejíž profil dokumentuje vývoj pražské prvohorní pánve ve svrchním siluru a spodním devonu, na tomto území se nachází několik významných nalezišť zkamenělin.
Český kras, Praha, Klapice – přírodní rezervace
Na jihozápadním okraji Prahy, mezi Kosoří a Radotínem, obtéká Šachetský potok vápencový ostroh, vyhlášený v roce 1988 za přírodní rezervaci o výměře 16 ha. Hlavním předmětem ochrany jsou teplomilné doubravy se vzácnou květenou. Na jihozápadním svahu je rozsáhlá výsadba nepůvodní borovice černé, kde však dosud přežívají mnohé cenné druhy. Území rezervace je součástí CHKO Český kras.
Český kras, Praha, Prokopské údolí, Hemrovy skály – přírodní rezervace
Prokopské údolí patří k botanicky nejzajímavějším a nejcennějším územím hlavního města Prahy. Celá tato pozoruhodná oblast, která byla v roce 1978 vyhlášena za přírodní rezervaci, zabírá plochu více než 100 hektarů. V severozápadním výběžku tohoto území, v katastru městské části Jinonice, mezi Novou Vsí a Butovicemi, se nachází velmi nápadný skalní masiv, který bývá označován jako Hemrovy skály.
Český kras, Praha, Radotínské údolí – přírodní rezervace
Na samém jihozápadním okraji velké Prahy se nalézá přírodní rezervace Radotínské údolí. Vlastně menší část rezervace leží již mimo katastr hlavního města, ale opravdu jen malý kousek. Ze všech pražských přírodních rezervací je považována za nejcennější, však je zde udáváno na 600 druhů vyšších rostlin. Proto nikoho nepřekvapí, že je Radotínské údolí, i s přilehlými územími, součástí CHKO Český kras.
Český kras, Praha, U Nového mlýna – národní přírodní památka
Na pravém břehu pražského Dalejského potoka, naproti přírodní památky Opatřilka – Červený lom, byla v roce 1982 na ploše asi 12,5 hektaru vyhlášena národní přírodní památka U Nového mlýna. Předmětem ochrany jsou významné geologické profily v devonských vápencích s výskytem zkamenělin a s parastratotypem pro hranici mezi spodním a středním devonem a dále zbytky teplomilné květeny skalních stepí a teplomilných trávníků.
Český kras, Praha, Zmrzlík – přírodní památka
Na okraji Prahy, v těsném sousedství přírodní rezervace Radotínské údolí, se nachází přírodní památka Zmrzlík, vyhlášená na ochranu geologických profilů kopaninského souvrství siluru a staré zemědělské krajiny a na ni vázaných teplomilných společenstev rostlin. Přírodní památka je složena ze tří částí spojených ochranným pásmem, rozložených kolem Zadní Kopaniny a osady Zmrzlík, část území je součástí CHKO Český kras. Byla vyhlášena v roce 1988 na ploše 16 ha.
Český kras, Voškov – přírodní rezervace
Všichni určitě vědí, kde je Karlštejn. Většina lidí si hned vedle na mapě nejspíš vybaví i krásnou Hlásnou Třebáň (okres Beroun). Kolem Hlásné Třebáně tvoří Berounka táhlý oblouk a narozdíl od plochého levého břehu, kde řeka umožnila vznik obce, vede na břehu pravém pouze železniční trať a terén ihned prudce stoupá o více než 150 metrů. Celý svah je zalesněný a od roku 1972 chráněný jako Přírodní rezervace Voškov s rozlohou bezmála 30 hektarů.
Český kras, Vrch Mramor
Mezi historickým městečkem Liteň (okres Beroun), známým především z dob národního obrození, a vrchem Bacín, předvěkým kultovním místem, se nalézá nenápadný vrch Mramor (CHKO Český kras – mapa). Je porostlý listnatým lesem a protnutý zelenou turistickou značkou. Ačkoliv se nejedná o maloplošné chráněné území, ukrývá se zde nejeden botanický skvost.
Český kras, Zlatý kůň – národní přírodní památka
Nedaleko Koněprus se nalézá pověstmi opředené návrší Zlatý kůň (mapa), které bylo v roce 1973 prohlášeno chráněným územím, dnes je řazeno do kategorie národní přírodní památky. Chráněno je 37 ha, samotný vrch je vysoký 475 m n. m. a je tvořen převážně zkamenělým korálovým útesem ze staroprvohorních devonských dob. Ve svém nitru ukrývá známé Koněpruské jeskyně, na povrchu vystavuje krasové jevy, např. závrty a v kamenech ukrývá četné zkameněliny.
Český les, Lipovka – přírodní rezervace
Přírodní rezervace Lipovka, vyhlášená roku 1995 na 1,75 ha, se nalézá v Dyleňské hornatině v severní části Českého lesa nedaleko Brtné (okres Cheb), známé především svými kyselkami, měkkyní bažinnou v PR Mechové údolí a nověji též bioloukami a biopastvinami.
Český les, Mechové údolí – přírodní rezervace
Přírodní rezervace Mechové údolí, vyhlášená v roce 1998 na ploše ani ne 7 ha, by se klidně mohla jmenovat Ztracené údolí. Tento název by byl neméně trefný a přesný, jako údolí Mechové. Ačkoliv se vnucuje dojem, že jméno bylo vybráno podle hojného výskytu mechorostů, skutečným původcem jména je nedaleký Mechový vrch (642 m n. m.).
Chebská pánev, Děvín – přírodní rezervace
Na dohled známé NPR Soos (okres Cheb) se nalézá zajímavé území, od roku 1990 chráněné jako přírodní rezervace Děvín o výměře 6,5 ha. Jedná se o zbytek přirozeného toku Lužního potoka, který na základě snah ochranářů unikl v osmdesátých letech 20. století melioracím, a přilehlý les s malým přechodovým rašeliništěm s výskytem vzácných druhů rostlin a živočichů.
Chebská pánev, Kamenný dvůr
Některá botanicky zajímavá místa se nalézají na těch nejnepravděpodobnějších místech. Málem přímo pod dálničním sjezdem na Kynšperk nad Ohří (okres Sokolov), obklopena silnicemi a pásem bolševníkové buřeně, se ukrývá zajímavá mokřina se svahovým prameništěm slatinného charakteru. Místo je známé překvapivým nálezem vzácné pěchavy slatinné (Sesleria uliginosa), kterou zde na úpatí Slavkovského lesa jaksi nikdo neočekával. Už nikoli překvapivě je zde obklopena dalšími zajímavými, především mokřadními druhy.
Chebská pánev, Odrava u Slapan
Významný přítok Ohře, říčka Odrava, pramení na německé straně Českého lesa jen kousek od hranic, Horní Falcí opisuje velký oblouk a za Waldsassenem se vrací zpět a vstupuje na území Čech. Zde se její tok rozlije do přehradního jezera Jesenice a nedlouho poté se vlévá do řeky Ohře. Avšak ještě než začíná vzdutí přehradní nádrže, protéká Odrava Slapany, kde je velký jez a nad ním soustava tůní a slepých ramen, z hlediska rostlinstva nikoli nezajímavá.